2016학년도 새학기가 시작하면서 인제의과대학 PBL교육과정에 교류협정을 맺고 있는 일본 큐슈의과대학 학생 2명과 쥰텐도의과대학 학생 4명이 교환학생으로 참가하였다. 큐슈의과대학에서는 2016년 2월 22일(월)부터 2월 26일(금) 까지 의학과 2학년인 Komatsu Yushiro(남)과 Liu Zhiwen(여) 학생이 본교 의학과 2학년 '신장과 요로계, 내분비/영양 통합과정'의 신장과 요로계 과정 PBL에 참가하여 본교 학생들과 함께 PBL 학습을 진행하였다. 또한 쥰텐도의과대학에서는 3월 7일(월) Takehiko Yokomizo(쥰텐도의대 생화학교실)교수가 인솔교수로 함께 본교를 방문하였으며, 3월 7일(월)부터 3월 11일(금) 까지Junna Terao(의학과1), Azusa Takahashi(의학과1), Koichi Jingo(의예과2), Tomoya Hashimoto(의예과2) 학생이 내분비/영양 과정 PBL에 참가하여 본교학생들과 함께 PBL 학습을 진행하였다. 인제의과대학은 현재 100년 이상의 역사를 가진 일본의 큐슈의과대학, 치바의과대학, 쥰텐도의과대학과 학생교류협정을 체결하고 교환학생을 교류하고 있다. 본교에서는 PBL학습과 해운대 백병원에서의 선택 임상실습 과정을 학생교류를 위하여 매년 개설하고 있으며, 본교학생의 일본파견은 큐슈의대 해부학실습, 큐슈의대와 치바의대의 선택임상실습교류를 매년 계속하고 있으며 준텐도의과대학에서 기초의학연구와 임상실습은 2015년 교류협정체결 후 2017년부터 시행할 예정이다.